Ingénieur.e en bio-informatique F/H

PrÉsentation de la direction/structure d’accueil du poste

L’Université Paris Cité et l’INSERM U1138, au sein du Centre de recherche des Cordeliers (CRC), développent des recherches fondamentales, translationnelles et cliniques en biologie et en santé, notamment en cancérologie et en immunologie. La structure translationnelle d’immunomonitoring des ca nc ers, dirigée par le Pr F. Pagès et rattachée au service d’Immunologie biologique de l’Hôpital européen Georges-Pompidou (HEGP) et à l’équipe INSERM « Immunologie intégrative du c an cer », est spécialisée dans l’étude du microenvironnement tumoral et l’identification de biomarqueurs pronostiques et prédictifs de la réponse aux traitements, notamment aux immunothérapies. Ses travaux ont permis le développement de tests cliniques tels que l’Immunoscore, validé dans le cadre d’une étude internationale sur le c a ncer colorectal, ainsi que de l’IS-biopsie et de l’IS-IC. La structure participe également à des essais cliniques, dont l’étude de phase III ATEZOTribe 2. Ses recherches reposent sur l’analyse de données cliniques, génomiques, transcriptomiques et de pathologie digitale, en collaboration avec les services hospitaliers, notamment en anatomie pathologique et en chirurgie digestive, les équipes de bioinformatique et les centres de recherche partenaires, dont le PARCC. Le service d’Immunologie biologique réalise par ailleurs des analyses spécialisées du complément, des lymphocytes T, des auto-anticorps et du microenvironnement tumoral.

rÉsumÉ du poste

Participation à l’analyse biostatistique et bio-informatique de données cliniques et biologiques, notamment sur l’étude ancillaire de l’essai clinique de phase III Atezotribe2.
Missions principales : analyse et modélisation des données, développement de modèles prédictifs (survie, Random Forest, XGBoost), contrôle et structuration des données, ainsi que contribution aux études scientifiques.

DESCRIPTIF DES ACTIVITÉS

1. Gestion, analyse et modélisation de données
· Produire des statistiques descriptives et restituer des résultats sous formes tabulaire et gra-phique.
· Développer des modèles statistiques prédictifs (Analyse de survie, régressions, random forest, XGBoost,…).
· Assurer la reproductibilité, la documentation et la traçabilité des analyses.
· Structurer, documenter et contrôler la qualité des jeux de données.
2. Activités transversales
· Assurer une veille scientifique afin de proposer des méthodes d’analyses de données.
· Participer à l’élaboration des protocoles d’études et aux choix méthodologiques (design, objectifs, critère de jugement, population d'étude, plan d'analyse statistique…).
· Participer aux rapports scientifiques et à la valorisation des résultats.
3. Activités en bio-informatique (en support de l’équipe)
· Pathologie Digitale / analyses spatiales.
· Analyses transcriptomiques.
· Exploitation de base de données publiques.

Encadrement : non

Conditions particulières d'exercice

néant

Profil recherché

profil recherchÉ

Connaissances :

• Bio-informatique
• Bio-statistiques
• Apprentissage Automatique (Machine Learning)
• Analyse des données

Savoir-faire - Compétences opérationnelles :

• Maîtrise en méthodes statistiques appliquées aux sciences de la vie (descriptives, univariées, multivariées, régressions linéaire et logistique, modèles de survie, gestion des données man-quantes etc.)
• Solide expérience en méthodes d’apprentissage automatique (random forest, XGBoost…)
• Maîtrise des outils d’analyse de données (R ou Python

Savoir-être – Compétences comportementales :

• Bon relationnel et sens du travail en équipe
• Disponibilité et réactivité
• Organisation, ponctualité et rigueur
• Curiosité scientifique et esprit critique
• Autonomie

Niveau de diplôme souhaité (le cas échéant) :

Niveau I - Bac+5, Master, diplôme d'ingénieurs ou diplôme équivalent et Bac+8 Doctorat ou diplôme équivalent